法國HYDROPTIC公司——ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)主要用于對液體中的浮游動物樣品進行計數(shù)、大小測量、種類鑒定以及生物量測定。
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)系統(tǒng)是由ZooSCAN、ZooProcess和EcoTaxa網(wǎng)站等共同組成的,ZooSCAN是硬件部分,主要進行浮游動物樣品掃描,形成數(shù)字圖像。ZooProcess和EcoTaxa是軟件部分,分別以標(biāo)準(zhǔn)化的程序處理原始圖像、對不同個體的形態(tài)參數(shù)進行自動測量和對圖像中的浮游動物進行自動分類和計數(shù)。
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)工作流程:
1)掃描空白背景;
2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數(shù)據(jù)信息;
3)通過ZooProcess軟件,標(biāo)準(zhǔn)化原始圖片,提取并測量圖片中不同個體的形態(tài)參數(shù);
4)通過對形態(tài)學(xué)參數(shù)的提取與分析,可進一步獲得樣品的粒徑組成、生物學(xué)體積等信息
5)過EcoTaxa網(wǎng)站已建立的圖像培訓(xùn)數(shù)據(jù)庫,針對已掃描的樣品圖像進行浮游動物的自動識別,獲得不同類群浮游動物的數(shù)量。
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)應(yīng)用領(lǐng)域:
生態(tài)學(xué)調(diào)查、漁業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、教育。
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)原理:
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Microscope 實驗室 | ZooSCAN 實驗室+野外(現(xiàn)場) | UVP 野外(水下原位) |
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)(CNRS專利)系統(tǒng)使用掃描儀技術(shù),這項技術(shù)帶有傳統(tǒng)照明設(shè)備和一個用于放置液體的浮游動物樣品水密的掃描室。ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)可以記錄高分辨率的數(shù)字化圖像,然后這些數(shù)字化的圖像可以通過電腦程序進行研究。雖然這個數(shù)字化的浮游動物圖像比使用一個雙目顯微鏡獲得的圖片的分辨率要低,但這項技術(shù)已被證實,在有大型樣品種類時使用是再適合不過了。通過與EcoTaxa網(wǎng)站上已有的浮游動物數(shù)據(jù)庫進行對照,可以自動的識別、鑒定樣品中浮游動物的種類。
浮游動物識別、鑒定網(wǎng)站——EcoTaxa
EcoTaxa網(wǎng)站主界面
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EcoTaxa浮游動物分類界面
為什么使用ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)?
傳統(tǒng)分析方法(鏡檢)
◇ 需要專業(yè)人員
◇ 操作過程相當(dāng)繁瑣
◇ 后期數(shù)據(jù)處理工作量極大
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)(超高質(zhì)量圖像掃描)
◇ 無需專業(yè)人員(建庫之后)
◇ 操作過程非常簡單
◇ 后期數(shù)據(jù)由軟件自動處理
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)規(guī)格:
◇ 型號:ZSCA04
◇ 規(guī)格 (LxWxH): 60 x 54 x 36 cm (關(guān)上蓋子)
◇ 質(zhì)量: 25 Kg
◇ 輸入電壓: 110 to 230 VAC, 50 to 60 Hz
◇ 接口: USB 2.0
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)特性:
◇ 應(yīng)用(專):專門用于浮游動物研究
◇ 功能(強):自動鑒定、分類、計數(shù)、計算生物量
◇ 效率(高):快速批量分析大量浮游動物樣品
◇ 信息量(大):經(jīng)緯度、采樣深度、網(wǎng)型、網(wǎng)口面積等
◇ 照明系統(tǒng)(優(yōu)):確保圖像的質(zhì)量和對比度
◇ 圖像解析度(高):4800dpi
◇ 圖像分辨率(高):14150 x 22640 (3.2億像素,1GB)
ZooSCAN正在進行掃描 | 回收ZooSCAN樣品池中的樣品 |
浮游動物樣品池,透明度佳 | ZooSCAN主機+ZooProcess軟件 |
代表文獻:
1.孫 松, 畢永坤, 孫曉霞,2013.基于圖像技術(shù)的膠州灣浮游動物優(yōu)勢種體型參數(shù)與生物量轉(zhuǎn)換關(guān)系研究(RELATIONSHIP BETWEEN SHAPE PARAMETERS AND DRY WEIGHT OF THE DOMINANT ZOOPLANKTON IN JIAOZHOU BAY BASED ON IMAGE METHOD).海洋與湖沼(OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA).44(1):15:22.
2.Pieter Vandromme, Lars Stemmann, Carmen Garcìa-Comas, Léo Berline, Xiaoxia Sun, Gaby Gorsky,2012.Assessing biases in computing size spectra of automatically classified zooplankton from imaging systems: A case study with the ZooScan integrated system.Methods in Oceanography.1–2:3–21.
3.Stéphanie Lelièvre, Elvire Antajan, and Sandrine Vaz,2012.Comparison of traditional microscopy and digitized image analysis to identify and delineate pelagic fish egg spatial distribution.Journal of Plankton Research.34(6):470-483.
4.Jesse R. Powell and Mark D. Ohman,2012.Use of glider-class acoustic Doppler profilers for estimating zooplankton biomass.Journal of Plankton Research.34(6):563-568.
5.Hirche, H., Alfred Wegener Inst. for Polar & Marine Res., Bremerhaven, Germany, Schulz, J., Hanken, T.,2012.A modular imaging system for collection and analysis of live and preserved zooplankton samples.OCEANS, 2012 - Yeosu.(1-4).
6.Lin Ye, Chun-Yi Chang, Chih-hao Hsieh,2011.Bayesian model for semi-automated zooplankton classification with predictive confidence and rapid category aggregation.Marine Ecology Progress Series.441:185-196.
7.孫曉霞, 孫 松, 王世偉, 劉夢壇, 趙永芳,2011."圖像自動識別技術(shù)在膠州灣浮游動物生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用(APPLICATION OF AUTOMATED IMAGE IDENTIFICATION IN ZOOPLANKTON
ECOLOGY STUDIES IN THE JIAOZHOU BAY)".海洋與湖沼(OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA).42(5):647:653.
8.Gaby Gorsky, Mark D. Ohman, Marc Picheral, Stéphane Gasparini, Lars Stemmann, Jean-Baptiste Romagnan, Alison Cawood, Stéphane Pesant, Carmen García-Comas and Franck Prejger,2010.Digital zooplankton image analysis using the ZooScan integrated system.Journal of Plankton Research.32(3):285-303.
9.Sabine Schultes, Rubens Lopes,2009.Laser Optical Plankton Counter and Zooscan intercomparison in tropical and subtropical marine ecosystems.Limnology and Oceanography.771-784.
10.LISA R. GILFILLAN, MARK D. OHMAN,2009.OCCURRENCE OF PLASTIC MICRO-DEBRIS IN THE SOUTHERN CALIFORNIA CURRENT SYSTEM.CalCOFI Rep..Vol. 50, 2009.
11.Fabien JOUENNE, Ian PROBERT and Daniel VAULOT,2008.Plankton taxonomy in the computer age.Cah. Biol. Mar..49 : 355-367.
12."G. Gorsky, L. Stemmann, R. Rakotomalala, S. Gasparini, F. Ibanez, E. Antajan, M. Picheral, C. Garcia
Comas",2007.HARMONIZATION OF SAMPLING METHODS AND TREATMENT OF ZOOPLANKTON TIME SERIES.Rapp. Comm. int. Mer Médit., 38, 2007.490.
13.L. Stemmann, J.B. Romagnan, M.G. Mazzocchi, C. Garcia Comas, E. Antajan, M. Picheral, N.J. Daly Yahia, G. Gorsky,2007.ZOOPLANKTON COMMUNITY STRUCTURE AND SIZE DISTRIBUTION IN THE SOUTHERN TYRRHENIAN SEA DURING THE 2005 CIESM SUB 1 AND SUB 2 CRUISES.Rapp. Comm. int. Mer Médit., 38, 2007.606.
14."By Mark C. Benfi eld, Phi l ipp e Gros j ean, Phi l F. Culverhouse , Xabi er Irigoi en,
Michael E . Si eracki , An gel Lopez-Urrutia, Hans G. Dam, Qiao Hu,
Cabel l S . Davis , Al len Hansen, Cynthia H. Pi l skaln, Edward M. Riseman,
H oward Sc hultz, Paul E . Utgoff, and Gabri el Gorsky",2007.RAPID: research on automated plankton identification.Oceanography.20(2):172-187.
15.par Warembourg, C., Grosjean, Philippe, Picheral, M., Ibanez, F., Gorsky, G.,2005.Le ZOOSCAN: un système d’imagerie rapide pour la mesure et la classification automatique du zooplancton.Référence J. Recherche Océanographique, 30, (page 1-12) ..
16.Philippe Grosjean, Marc Picheral, Caroline Warembourg and Gabriel Gorsky,2004.Enumeration, measurement, and identification of net zooplankton samples using the ZOOSCAN digital imaging system.ICES Journal of Marine Science.61(4):518-525.
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法國HYDROPTIC公司UVP6-HF水下顆粒物和浮游動物圖像原位采集系統(tǒng)介紹.pdf
法國HYDROPTIC公司UVP6-LP水下顆粒物和浮游動物圖像原位采集系統(tǒng)介紹.pdf
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